照常进行修业之旅的小智（松本梨香,配音）,小刚（上田祐司,配音）,小霞（饭塚雅弓,配音）一行辗转来到水之都奥多马雷参加紧张刺激的水上竞赛。奥多马雷流传着一个精彩的传说,在很久很久以前,岛上的老夫妇捡到一对孤儿兄妹,当邪魔出现时,两兄妹化作威力强大的神奇宝贝拉帝欧斯和拉帝亚斯,他们击败邪魔,并赐予奥多马雷人民名为“心灵水滴”的宝石作为守护。时至今日,神圣的心灵之滴却引起一对盗贼姐妹（释由美子,配音）的垂涎。她们在追踪妹妹拉帝亚斯（折笠富美子,配音）时遭遇小智并受挫,贪欲将带给水都史无前例的灾难……,本片为神奇宝贝系列第五部电影剧场版。
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