2029年3月某日,某国大使馆遭到一群经大规模义体改造的武装分子的入侵,众多外国使节及其同侪眷属沦为人质,事态十万火急。草薙素子（坂本真绫,配音）召集巴特（松田健一郎,配音）,陀古萨（新垣樽助,配音）等得力属下,并制定了周密的营救计划。谁知当一切都按部就班进行之时,意外突然发生。与此同时,距离大使馆不远的一座摩天大楼内,日本首相遭到密码箱炸弹的暗杀,素子之前的上司陆军501机关的机关长库露兹（浅野麻由美,饰）也在爆炸中丧生。经过缜密追查,素子等人发现一种能够篡改记忆的病毒正在网络蔓延,而她的身世居然和一连串的事件有着密切联系。危机当前,阴谋悄然复出水面……,本片根据士郎正宗的同名原作改编,系《攻壳机动队》诞生25周年纪念作品。
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