X档案关闭后,穆德（David,Duchovny,大卫•杜楚尼,饰）和斯科莉（Gillian,Anderson,吉莲•安德森,饰）被分开。穆德受命执行监听工作,斯科莉则回到学院读书。,某日国会议员麦特森（Raymond,J.,Barry,饰）向穆德透露一条消息,称在波多黎各接收到外星人的电讯。为了在特种部队之前找到外星人的证据,穆德只身前往。得知消息的斯科莉赶到穆德住处,从电脑中的旅客名单中找到线索,尾随来到波多黎各。,在波多黎各阿雷希伯,穆德偶遇一个当地人,并从他手里得到一幅外星人的画。但不久后此人便离奇死去。穆德最终能否找到外星人来访的证据？
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