明朝崇祯15年,全国内忧外患,大将孙传庭（戴立忍,饰）临危受命带着妻子冯氏（冯波,饰）来到潼关抵抗李自成的军队。与此同时游医吴又可（冯远征,饰）怀着济世救人之心来到潼关拜访师傅——药局提领赵川（钱学格,饰）。大敌当前,孙传庭军中士兵染上怪病,同时还要面对崇祯皇帝（余少群,饰）的催促出兵和潼关豪绅顾清远（马精武,饰）等人的自私敛财。赵川因施救不力以身殉职,吴又可在危难之时挺身而出,靠着不同寻常的治疗方法与孙传庭惺惺相惜。最后瘟疫终于被控制住,但是国家的病症能否被战争治好吴又可和孙传庭都无法预料。
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